紀念館總占地面積為8020平方米，由南北兩座主體大樓、東、西廣場和門樓等組成；兩座主體大樓為三層劵拱的西式建筑，南樓設(shè)“帥府百年”復原陳列，北樓有“孫中山在廣州三次建立革命政權(quán)”的基本史料陳列和專題陳列。
　　1981年，中國人民政治協(xié)商會議廣東省廣州市第五屆委員會第一次會議提案：請盡早維修座落本市河南的當年孫中山先生大元帥府舊址案。
　　1983年，孫中山大元帥府舊址被廣州市人民政府確定為廣州市第二批重點文物保護單位。
　　1984年，中國人民政治協(xié)商會議廣東省廣州市第六屆委員會第二次全體會議提案：請從速修復開放孫中山先生在廣州的大元帥府大本營舊址。
　　1992年，使用大元帥府舊址的廣東農(nóng)業(yè)機械供給公司作了為恢復“孫中山大元帥府”舊址搬遷廣東農(nóng)業(yè)機械供給公司申請立項的報告。同年，廣州市文物治理委員會關(guān)于市人大代表建議將孫中山大元帥府改作孫中山紀念館作為批復。
　　1996年11月，孫中山大元帥府舊址被國務院公布為全國重點文物保護單位。
　　1998年10月19日，接收大元帥府舊址，完成舊址內(nèi)首期60余戶居民搬遷工作，籌備建館。
　　1999—2000年，維修大元帥府南樓、北樓及周邊環(huán)境整治。
　　2001年7月，完成南樓 “百年帥府”復原陳列展覽，并實行首期開放
　　2001年12月，完成北樓“孫中山三次在廣州建立政權(quán)”史料陳列展覽，并實行第二期開放。
　　2002年，開始第二期70余戶居民搬遷工作及大元帥府舊址大門樓復原工程。